Rutila Casillas llega a la cárcel para comprobar que su papá esta vivo, al descubrirlo le da la noticia de que será abuelo, Aurelio la maldice al saber quién es el padre y el reto entre padre e hija queda vivo. De regreso, a medio camino, un comando intercepta la camioneta de Rutila Casillas, el Chema Venegas la baja de su vehículo y cuando esta a punto de matarla ella le confiesa que es el padre de su hijo. Así es como finalizó la segunda temporada de El señor de los cielos, para los amantes de esta historia les tenemos una buena noticia, la tercera temporada ya esta a punto de dar inicio con las grabaciones. La historia sobre el narcotráfico más exitosa esta de regreso.
Rafael Amaya continúa como el protagonista de esta serie, bajo el papel de Aurelio Casillas, la cual quedará en la historia de Telemundo, debido a que por vez primera esta televisora transmitirá la tercera temporada de una de sus producciones, no habría ser genios para saber que esto sucedería, aún mas después de ser acredores al Emmy Internacional en la categoría de programa extranjero dentro del horario estelar de Estados Unidos en el 2011.
En esta tercera temporada, Aurelio Casillas se encuentra preso en una celda de alta seguridad de la marina mexicana, soportando el duro castigo de torturadores y buscando su escape. En un escenario plagado de sospechas y atrocidades, comenzará un juego de traiciones en el que Aurelio, motivado por la sed de venganza y queriendo recuperar el poder perdido, irá más allá de todos los límites.
Pero no todo es alegría para los seguidores de esta producción, debido a que uno de los pilares de la historia no estará presente en esta tercera temporada, Chacorta interpretado por Raúl Méndez no llego a un acuerdo con la televisora estadounidense y no se involucro en esta tercera entrega. «Chacorta terminó su viaje en El Señor De Los Cielos, por diferencias de ambas partes, no se pudo llegar a un acuerdo con Telemundo por lo tanto el personaje ya no estará más presente.” comentó el actor en un comunicado.
El capítulo final de la segunda temporada de El Señor de los Cielos se ubicó en el primer lugar de las audiencias en la televisión en español y ocupó el primer puesto en inglés y español en Los Ángeles y Miami. La segunda temporada de El Señor de los Cielos se convirtió también en la serie más exitosa de Telemundo en plataformas digitales alcanzando tres millones de usuarios en línea y dispositivos móviles, generando 52 millones de visitas y 21 millones de vistas de video.